HX-XAFS group of Nagoya Univ. SR-Center and Aichi SR

Demeter のインストール on FreeBSD (とりあえず atoms を使うために)

 git clone https://github.com/bruceravel/demeter.git

でソースツリーをまるごと持ってくる。

demeter/bin/datoms が実行できるようにすることをゴールにする。
datoms の中で use されるモジュールの準備 (~/ は個人の root)
1. demetr/lib をどっか適当な場所にコピーする、例えば
```
 cp -R demeter/lib ~/perlLib/demeter 
```
2. File::Wich モジュールを持ってくる。例えば File::Which から download して同じ場所に置いておく
```
 mkdir ~/perlLib/File
 cp Which.pm ~/perlLib 
```
3. あるいは
```
 sudo pkg instal sysutils/p5-File-Which 
```
4. その他のモジュールも持ってくる (download して perlLib に置くのでも OK)
```
 sudo pkg install lang/p5-List-MoreUnits
 sudo pkg install textproc/p5-Pod-POM
 sudo pkg install devel/p5-Regexp-Assemble
 sudo pkg install textproc/p5-Text-Template
 sudo pkg install science/p5-Chemistry-Elements
 sudo pkg install math/p5-Math-Spline
 sudo pkg install textproc/p5-YAML-Tiny
```
5. elam.db を作る。準備として
```
 sudo pkg install devel/p5-DateTime
```
  　を install した後、
```
 demeter/lib/Xray/data 
```
  にある elam2st.PL の先頭行を編集して perl が実行できるようにして実行する。できた demeter/lib/Xray/Absorption/elam.db を Elam.pm 等と同じ場所にコピーする。
```
 cp demeter/lib/Xray/Absorption/elam.db ~/perlLib/demeter/Xray/Absorption/
```
6. hubbel_g.db も作る。
```
 demetr/lib/Xray/data 
```
  にある /hubble_g2st.PL の先頭行を編集して perl が実行できるようにしてから実行する。できた demete/lib/Xray/Absorption/hubble_g.db も Elam.pm 等と同じ場所にコピーする。
7. PDL関連のモジュールも持ってくる。
  - PDL/Core : PDL::Core から Core.pm を perlLib/PDL にダウンロード
  - PDL/Exporter : https://metacpan.org/source/ETJ/PDL-2.021/Basic/Core/Exporter.pm
  - PDL/Options : https://metacpan.org/source/ETJ/PDL-2.021/Basic/Options.pm
  - PDL/Types : https://metacpan.org/source/ETJ/PDL-2.021/Basic/Core/Types.pm.PL をダウンロードして先頭に #!/usr/local/bin/perl を追加して実行。
  - PDL : https://metacpan.org/source/ETJ/PDL-2.021/Basic/PDL.pm
  - PDL/Stats/GLM : PDL::Stats::GLM から GLM.pm を perlLib/PDL/Stats にダウンロード。

 tar xzvf PDL-Stats-0.74.tar.gz

した後、

環境変数 PERL5LIB に上記のパスを通す

 setenv PERL5LIB ~/perlLib/demeter/:~/perlLib/